net use コマンドを使用できますか

WebDrive をインストールしたコンピューターで net use コマンドを使用できますか?

もちろん可能です。
ただし、このコマンドは Windows のドライブマッピング機能を使用するため WebDrive は使用されません。

コマンドで WebDrive NextGen を使用する場合、WebDriveCLI を使用して --mount コマンドでマッピングする必要があります。
詳細は『コマンドラインでサーバーに接続する方法』をご参照ください。