WebDrive を 2 台の PC で使用しているのですが、アップロードされたファイルがもう 1 台の PC の WebDrive から見ることができません。

この問題を回避するには、プログラム設定 ⇒ キャッシュ設定 ⇒ オプション で「シングルユーザー (最速) – キャッシュファイルが最新であることが前提」から、「マルチユーザー – キャッシュファイルが最新であるかどうかサーバーに確認」に変更してください。